Die Schule gliedert sich in sieben Gruppen in vier Stufen:
- Grundstufe 1 / Grundstufe 2
- Mittelstufe 1 / Mittelstufe 2
- Hauptstufe
- Berufsorientierungsstufe 1 / Berufsorientierungsstufe 2
Pädagogische Einheit der Anne-Frank-Schule ist die Gruppe, in der bis zu 8 Kinder unterrichtet werden. Die Gruppenbildung erfolgt nach pädagogischen Gesichtspunkten, wobei Entwicklungsalter, Lernbedürfnisse und soziale Aspekte den Ausschlag geben. So ist auch due Verweildauer in der jeweiligen Klasse oder Stufe von Schüler zu Schüler verschieden.
